Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUTAO60888 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUTAO60888 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUTAO60888 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUTAO60888 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUTAO60888 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUTAO60888 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUTAO60888 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms