Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
INO80Q9ULG1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms