Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT8Q9UFF9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT8Q9UFF9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms