Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC17Q9NP64 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms