Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms