Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUDCD1Q96RS6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUDCD1Q96RS6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms