Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC7Q96M83 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC7Q96M83 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms