Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPGRIP1Q96KN7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms