Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDKL3Q8IVW4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms