Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM228AQ86W67 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms