Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRX1Q86UT6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRX1Q86UT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms