Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms