Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NOM1Q5C9Z4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOM1Q5C9Z4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms