Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ssbp4Q3U4B1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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