Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1123Q1RME4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1123Q1RME4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms