Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKEQ14164 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IKBKEQ14164 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IKBKEQ14164 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms