Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL3Q13618 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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