Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PKD2Q13563 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PKD2Q13563 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
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