Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDE3BQ13370 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE3BQ13370 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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