Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 HSC82YMR186W 2118 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YGL177WYGL177W 348 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 HTD2YHR067W 843 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 AYR1YIL124W 894 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 UTP30YKR060W 825 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 PAU23YLR037C 375 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 FYV6YNL133C 522 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YAP7YOL028C 738 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YOR097CYOR097C 528 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YOR277CYOR277C 309 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 SAP190YKR028W 3102 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 APL5YPL195W 2799 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.96□□□□□ -2.1
USB1Q12208 INP51YIL002C 2841 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 HRD3YLR207W 2502 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YCT1YLL055W 1596 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 RSM24YDR175C 960 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 SEC4YFL005W 648 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MIG2YGL209W 1149 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YHL044WYHL044W 708 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 VMA10YHR039C-A 345 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 VPS25YJR102C 609 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 PEX17YNL214W 600 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 TPS2YDR074W 2691 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YJL049WYJL049W 1353 nt1.95□□□□□ -2.1
USB1Q12208 TRM82YDR165W 1335 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 ELG1YOR144C 2376 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 ERG28YER044C 447 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YER119C-AYER119C-A 372 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MPO1YGL010W 525 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MPC1YGL080W 393 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 VPH2YKL119C 648 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YKL131WYKL131W 522 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 RPL36AYMR194W 303 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YPL142CYPL142C 318 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 NOP12YOL041C 1380 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YPR097WYPR097W 3222 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 PUF4YGL014W 2667 nt1.94□□□□□ -2.1
USB1Q12208 ART10YLR392C 1557 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 COS111YBR203W 2775 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YOL098CYOL098C 3114 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YDR203WYDR203W 318 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YEL010WYEL010W 351 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MEI4YER044C-A 1227 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MAM1YER106W 909 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YGL117WYGL117W 798 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YHR022CYHR022C 771 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 PSF2YJL072C 642 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 CCE1YKL011C 1062 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 HYM1YKL189W 1200 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 RNP1YLL046C 750 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MTG1YMR097C 1104 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 ESF2YNR054C 951 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 UBX3YDL091C 1368 nt1.93□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YPD1YDL235C 504 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YER138W-AYER138W-A 105 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YMR31YFR049W 372 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YKL069WYKL069W 543 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 PAU8YAL068C 363 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YLR050CYLR050C 486 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 ARC18YLR370C 537 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 IRC21YMR073C 606 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MRPL17YNL252C 846 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 PAU20YOL161C 363 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MRPL40YPL173W 894 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 snR191snR191 274 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YBR090CYBR090C 369 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 BI3Q0115 1554 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 RGA1YOR127W 3024 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 TAE2YPL009C 3117 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YMR045CYMR045C 5268 nt1.92□□□□□ -2.1
USB1Q12208 RLF2YPR018W 1821 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 KOG1YHR186C 4674 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 SRB4YER022W 2064 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YEL1YBL060W 2064 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 SNX41YDR425W 1878 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YKL075CYKL075C 1353 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 RGI1YER067W 486 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YER189WYER189W 369 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YAL037WYAL037W 804 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 MRP49YKL167C 414 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 YBL062WYBL062W 381 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 ARF3YOR094W 552 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 VMA9YCL005W-A 222 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 TFC3YAL001C 3483 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 PSK2YOL045W 3306 nt1.91□□□□□ -2.1
USB1Q12208 BAS1YKR099W 2436 nt1.9□□□□□ -2.1
USB1Q12208 RAV1YJR033C 4074 nt1.9□□□□□ -2.1
USB1Q12208 VTC1YER072W 390 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 COG7YGL005C 840 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YIL012WYIL012W 342 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 YIL141WYIL141W 390 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 DIA1YMR316W 1011 nt1.9□□□□□ -2.11
USB1Q12208 ATG19YOL082W 1248 nt1.9□□□□□ -2.11
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