Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 PHM6YDR281C 315 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 EMI1YDR512C 564 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 SMX2YFL017W-A 234 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YGR053CYGR053C 852 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YLR269CYLR269C 351 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YPL197CYPL197C 414 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 SWH1YAR042W 3567 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 CEP3YMR168C 1827 nt3.7□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 ICR1ICR1 3199 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 USA1YML029W 2517 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YER181CYER181C 324 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 CRG1YHR209W 876 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 RMP1YLR145W 606 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 RIM11YMR139W 1113 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 FMP23YBR047W 528 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YPL142CYPL142C 318 nt3.69□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YGL140CYGL140C 3660 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 CHD1YER164W 4407 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 LOS1YKL205W 3303 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YEL1YBL060W 2064 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 BMH2YDR099W 822 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 OTU2YHL013C 924 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 PEP8YJL053W 1140 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 VID24YBR105C 1089 nt3.68□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 MTC4YBR255W 2085 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YPR003CYPR003C 2265 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 BAR1YIL015W 1764 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YDR442WYDR442W 393 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 RPL27BYDR471W 411 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YGR242WYGR242W 309 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 OST2YOR103C 393 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YOR277CYOR277C 309 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 CPA2YJR109C 3357 nt3.67□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 MAK5YBR142W 2322 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 ATP25YMR098C 1839 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 VEL1YGL258W 621 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 TCD1YHR003C 1290 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YKL136WYKL136W 399 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YLR416CYLR416C 399 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 SWM2YNR004W 441 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 NTC20YBR188C 423 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 MPS1YDL028C 2295 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 GPI10YGL142C 1851 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 CWH41YGL027C 2502 nt3.66□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YNR063WYNR063W 1824 nt3.65□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 PDS5YMR076C 3834 nt3.65□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 TOP1YOL006C 2310 nt3.65□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 ARG2YJL071W 1725 nt3.65□□□□□ -1.82
HAL9Q12180 YGR237CYGR237C 2358 nt3.65□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YDR149CYDR149C 708 nt3.65□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 IES6YEL044W 501 nt3.65□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 PDR17YNL264C 1053 nt3.65□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 GPI17YDR434W 1605 nt3.65□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 COP1YDL145C 3606 nt3.65□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 MYO3YKL129C 3819 nt3.65□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 CDC40YDR364C 1368 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 MAL33YBR297W 1407 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 CDC50YCR094W 1176 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 FRQ1YDR373W 573 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 SMB1YER029C 591 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YGL042CYGL042C 306 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 RPS0AYGR214W 759 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YMR141CYMR141C 309 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 RRT16YNL105W 429 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 FRE8YLR047C 2061 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 ECM16YMR128W 3804 nt3.64□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 MSL5YLR116W 1431 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 MCM7YBR202W 2538 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YGR073CYGR073C 372 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YKL222CYKL222C 2118 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 ADI1YMR009W 540 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 RAD14YMR201C 1116 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 HHF2YNL030W 312 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 PEX11YOL147C 711 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 ELM1YKL048C 1923 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 CCM1YGR150C 2595 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 RED1YLR263W 2484 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 SRB4YER022W 2064 nt3.63□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YCK2YNL154C 1641 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 RAD4YER162C 2265 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YPS5YGL259W 498 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 VOA1YGR106C 798 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 CDC33YOL139C 642 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 HHF1YBR009C 312 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 TCB3YML072C 4638 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 UTP13YLR222C 2454 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 PWP2YCR057C 2772 nt3.62□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 HOP1YIL072W 1818 nt3.61□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 SRC1YML034W 2505 nt3.61□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt3.61□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 YDR431WYDR431W 312 nt3.61□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 SMT3YDR510W 306 nt3.61□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 PDX1YGR193C 1233 nt3.61□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 CHA4YLR098C 1947 nt3.61□□□□□ -1.83
HAL9Q12180 PBS2YJL128C 2007 nt3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms