Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 PGA1YNL158W 597 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 PDR15YDR406W 4590 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 BAR1YIL015W 1764 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 NDD1YOR372C 1665 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 WIP1YDR374W-A 270 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 CYM1YDR430C 2970 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 RRT13YER066W 558 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YLR302CYLR302C 363 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YNL179CYNL179C 438 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 FSH3YOR280C 801 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 TLC1TLC1 1301 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 MDM30YLR368W 1797 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 SSB2YNL209W 1842 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YMR196WYMR196W 3267 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 TAF5YBR198C 2397 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 VIP1YLR410W 3441 nt4.62□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 SPC72YAL047C 1869 nt4.61□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YEL045CYEL045C 426 nt4.61□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 HMF1YER057C 390 nt4.61□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt4.61□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YPL039WYPL039W 951 nt4.61□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YPL238CYPL238C 390 nt4.61□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 SLM6YBR266C 453 nt4.61□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 HOYDL227C 1761 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YJR030CYJR030C 2238 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 RPS29BYDL061C 171 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 ERG28YER044C 447 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YER066C-AYER066C-A 501 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 CDC26YFR036W 375 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 RPB9YGL070C 369 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YGR151CYGR151C 336 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YPL080CYPL080C 327 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 VHC1YBR235W 3363 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YSW1YBR148W 1830 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 APC4YDR118W 1959 nt4.6□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YLR001CYLR001C 2589 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 MSH4YFL003C 2637 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 KGD1YIL125W 3045 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 AKL1YBR059C 3327 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 VID22YLR373C 2706 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 PRE8YML092C 753 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 NUP116YMR047C 3342 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YOR170WYOR170W 306 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YBR259WYBR259W 2067 nt4.59□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 GAL4YPL248C 2646 nt4.59□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 LCB4YOR171C 1875 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 KRI1YNL308C 1776 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 MAL33YBR297W 1407 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 HTA1YDR225W 399 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 IRC23YOR044W 474 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 PFY1YOR122C 381 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YPL229WYPL229W 621 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 FEX2YPL279C 1128 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 NTC20YBR188C 423 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 FRE4YNR060W 2160 nt4.58□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YDL180WYDL180W 1644 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 GAC1YOR178C 2382 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YRB1YDR002W 606 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 NOP19YGR251W 591 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YGR269WYGR269W 327 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 INN1YNL152W 1230 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 LTP1YPR073C 486 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YCL023CYCL023C 348 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 SRP68YPL243W 1800 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 RDH54YBR073W 2877 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 ADP1YCR011C 3150 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 KIN82YCR091W 2163 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 RPL30YGL030W 318 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 SGN1YIR001C 753 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 PAC1YOR269W 1485 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YKL100CYKL100C 1764 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 RPS26BYER131W 360 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YFR056CYFR056C 369 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YPL142CYPL142C 318 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YPR059CYPR059C 387 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YKL222CYKL222C 2118 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 GDH2YDL215C 3279 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 EMP70YLR083C 2004 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 PRM15YMR278W 1869 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 ALO1YML086C 1581 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 RPL34AYER056C-A 366 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 APQ12YIL040W 417 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YBL073WYBL073W 312 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 PBS2YJL128C 2007 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 SSP1YHR184W 1716 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 CHL1YPL008W 2586 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YGL088WYGL088W 366 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 PXR1YGR280C 816 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 ATP22YDR350C 2055 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 YER077CYER077C 2067 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA3Q06623 SNF2YOR290C 5112 nt4.53□□□□□ -1.69
HDA3Q06623 SAP4YGL229C 2457 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA3Q06623 SWI3YJL176C 2478 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA3Q06623 OPT2YPR194C 2634 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA3Q06623 PEX5YDR244W 1839 nt4.52□□□□□ -1.69
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