Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	SWD3	YBR175W	948 nt		3.05	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YCL007C	YCL007C	393 nt		3.05	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	LST4	YKL176C	2487 nt		3.05	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YJL132W	YJL132W	2253 nt		3.05	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	NMA111	YNL123W	2994 nt		3.05	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	SKO1	YNL167C	1944 nt		3.05	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	MET6	YER091C	2304 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	ADY4	YLR227C	1482 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YDR262W	YDR262W	819 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	PRE1	YER012W	597 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	SAE2	YGL175C	1038 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	SDS22	YKL193C	1017 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	ADI1	YMR009W	540 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	ATX1	YNL259C	222 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	RPL23A	YBL087C	414 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	CDC20	YGL116W	1833 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YCL019W	YCL019W	5313 nt		3.04	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	FLO11	YIR019C	4104 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	SLF1	YDR515W	1344 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	KIN82	YCR091W	2163 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YGL159W	YGL159W	1113 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	YKL123W	YKL123W	381 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	CUR1	YPR158W	759 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	ADF1	YCL058W-A	342 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	CDC55	YGL190C	1581 nt		3.03	□□□□□ -1.92
MRD1	Q06106	JJJ2	YJL162C	1752 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	SRB4	YER022W	2064 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	KEI1	YDR367W	666 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	RPL11B	YGR085C	525 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	MRPL38	YKL170W	417 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	MST28	YAR033W	705 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YNL203C	YNL203C	612 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YOR152C	YOR152C	771 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	RPL11A	YPR102C	525 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	snR43	snR43	209 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	ESL1	YIL151C	3357 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	PFF1	YBR074W	2931 nt		3.02	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	SAP1	YER047C	2694 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	SKT5	YBL061C	2091 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	NEW1	YPL226W	3591 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	NTF2	YER009W	378 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YIP1	YGR172C	747 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	PCL5	YHR071W	690 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YJL147C	YJL147C	1149 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YNR025C	YNR025C	360 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	CSI2	YOL007C	1026 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	AFT2	YPL202C	1251 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	AXL1	YPR122W	3627 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	REF2	YDR195W	1602 nt		3.01	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YKL075C	YKL075C	1353 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	PRP8	YHR165C	7242 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YDR209C	YDR209C	414 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	PNC1	YGL037C	651 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	RPL27A	YHR010W	411 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	PEX18	YHR160C	852 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YIL174W	YIL174W	228 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	ECI1	YLR284C	843 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YRO2	YBR054W	1035 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	NFT1	YKR103W	3657 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	ASI3	YNL008C	2031 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YKL100C	YKL100C	1764 nt		3	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	CYR1	YJL005W	6081 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YDR338C	YDR338C	2088 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	RSM18	YER050C	417 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	MIC19	YFR011C	513 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	AIM18	YHR198C	966 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YET1	YKL065C	621 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	REC102	YLR329W	795 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	SEC66	YBR171W	621 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	NTC20	YBR188C	423 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YCK2	YNL154C	1641 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	AVT2	YEL064C	1443 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	BCK1	YJL095W	4437 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	ARK1	YNL020C	1917 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	PDR3	YBL005W	2931 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	AI2	Q0055	2565 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	NET1	YJL076W	3570 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	STI1	YOR027W	1770 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	PBP4	YDL053C	558 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YIL054W	YIL054W	318 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YKL066W	YKL066W	444 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	VPS63	YLR261C	327 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	VMA6	YLR447C	1038 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YCT1	YLL055W	1596 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	MED1	YPR070W	1701 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YNL193W	YNL193W	1677 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	MND1	YGL183C	660 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YHR213W	YHR213W	597 nt		2.97	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms