Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
RPS29P62273 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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