Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF1P55201 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms