Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MANFP55145 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MANFP55145 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MANFP55145 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MANFP55145 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MANFP55145 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MANFP55145 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MANFP55145 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MANFP55145 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MANFP55145 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms