Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAD23AP54725 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD23AP54725 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms