Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE6CP51160 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms