Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT3P49368 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCT3P49368 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCT3P49368 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCT3P49368 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT3P49368 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCT3P49368 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCT3P49368 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCT3P49368 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms