Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD1P29536 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms