Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMA1P25786 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA1P25786 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms