Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCFC2P16383 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms