Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RARGP13631 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARGP13631 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARGP13631 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARGP13631 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARGP13631 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARGP13631 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARGP13631 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms