Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFHP12036 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFHP12036 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFHP12036 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFHP12036 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEFHP12036 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEFHP12036 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEFHP12036 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEFHP12036 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEFHP12036 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEFHP12036 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEFHP12036 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEFHP12036 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEFHP12036 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEFHP12036 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEFHP12036 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms