Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGKV1-17P01599 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-17P01599 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms