Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PMD0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PMD0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PMD0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PMD0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PMD0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PMD0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PMD0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E9PMD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E9PMD0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E9PMD0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E9PMD0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms