Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3Q9UKS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms