Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PODXL2Q9NZ53 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms