Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC3H12CQ9C0D7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms