Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPCDQ9BVM2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPCDQ9BVM2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms