Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP6Q9BRS8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms