Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms