Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF2Q99496 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms