Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TEFMQ96QE5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TEFMQ96QE5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms