Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM47Q96LD4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms