Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPGRIP1Q96KN7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1Q96KN7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms