Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCC1Q96CN9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms