Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms