Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC117Q8IWD4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC117Q8IWD4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms