Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEACAM20Q6UY09 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM20Q6UY09 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms